Projekt FightAIDS @ Home se stal teprve druhým členem rodiny WCG, ale jednalo se o první projekt, který byl zaměřen na hledání léku na určitou nemoc. Jak už z názvu vyplývá, tou nemocí je metla lidstva posledních několika desetiletí. Jedná se o AIDS – syndrom získaného selhání imunity, který je způsoben virem HIV. Cílem tohoto projektu je vyvinout účinné léky proti AIDS na základě molekulární struktury. Několikrát se potvrdilo, že funkce molekuly je vázána na její tvar v prostoru. Projekt je konkrétně zaměřen na HIV proteázu, což je enzym nutný k dozrání tohoto viru.